En Junio de 1998 debido al explosivo aumento de las importaciones con destino a la ciudad de Iquique, Fast Air invierte en un depósito aduanero en dicha localidad, complementando la actividad comercial e industrial de la región.

En agosto de 1999 se constituye la empresa Fast Air Almacenes de Carga S.A., como administrador de los almacenes que tenía Fast Air carrier en el país.

En el año 2001, Fast Air junto con la empresa Láser Cargo, instalan en Rosario Argentina, un depósito aduanero en el aeropuerto internacional de esa ciudad.

En junio de 2003, con el fin de descentralizar el proceso de internación y nacionalización de la carga de importaciones, Fast Air inaugura un terminal en la ciudad de Punta Arenas. Este almacén cuenta con una superficie de 83 metros cuadrados para el almacenaje de carga general y espacio adicional para el almacenaje de automóviles.

En enero de 2004, Fast Air agrega un segundo almacén en la zona norte, esta vez en la ciudad de Antofagasta, para así colaborar con la actividad de la mediana y gran minería de la región. Este mantiene el mismo servicio y estándar de calidad que los almacenes ubicados en otras localidades.

A fines del año 2003, se inició la construcción de las nuevas instalaciones de Fast Air en Santiago. Con una inversión de aproximadamente MMUS$ 1,5, se construyó una gran bodega con una superficie de casi 7.500 metros cuadrados, duplicando la capacidad de las instalaciones originales.

En febrero de 2005 se inician las operaciones en este nuevo terminal.